首先我们应该知道，马德里商标是目前覆盖国家最多的商标注册途径之一，申请人可以把在本国注册的商标扩大保护到指定成员国。而欧盟商标，就只能在欧盟28个成员国使用，范围是小于马德里商标的。
但是虽然单一注册是以欧盟注册为典型的，但是欧盟商标体系却从来没有取代单一注册，申请人还是可以直接向某个国家提交申请，注册该国的商标。
而欧盟商标和马德里商标的区别只要有以下三点：
1、欧盟国家受到保护的范围有28个成员国，当然，如果未来有加入欧盟的国家，那么欧盟商标也会自动延伸保护该国家的。而马德里商标受到保护的范围则是以申请人指定的国家为限，而马德里成员国也包括了欧盟地区的成员国。
2、对于欧盟商标来说，申请人是没有资格限制的，任何人都可以提交申请。而马德里商标不同，申请人必须是成员国的企业或个人，而且申请人原属国必须要已经申请或有注册商标为基础，才能向世界知识产权组织提出申请。就比如，我国有申请人向申请马德里商标，那么在我国申请人必须要已经取得了商标注册证，或者是得到商标受理通知书。
3、欧盟商标的商标注册时间很短，大概5-8个月就完成了。而马德里商标的申请时间没有固定，需要根据各国不同的规定商标注册时间也不同，而且大部分国家的商标注册时间可长达18个月。
其实不管是欧盟商标还是马德里商标，都有各自的好处，而且比较的好一点就是，马德里商标只需要一份申请就可以指定多个国家甚至是全部成员国，而且申请费用也只有一份，比较低。所以，对于要想注册更多国家商标的申请人来说，马德里申请比较好。要是只注册几个成员国的商标，那么可以选择欧盟商标申请。
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